安徽農業大學動物科技學院前身為安徽農學院畜牧獸醫專業，1959年獨立建系，1994年更名為畜牧水產學院，2004年更名為動物科技學院。
學院現有畜牧學博士后流動站1個，動物遺傳育種與繁殖、動物病原生物學博士點2個，畜牧學、獸醫學等碩士點12個，動物科學、動物醫學、水產養殖學3個本科專業。其中動物科學專業為“國家綜合改革試點”專業、動物醫學專業為“國家特色示范專業”和“安徽省高水平大學建設”專業、水產養殖學專業為“安徽省綜合改革試點”專業。
學院現有教職工94人，其中教授27名，副教授34名，講師13人，高級實驗師5人，實驗師4人。學院現有國家現代農業產業技術體系崗位專家2名、安徽省現代農業產業技術體系首席、副首席專家各1名、安徽省體系崗位專家22名、10多人入選“安徽省‘三區’科技人才扶貧計劃”，10多人入選安徽省現代生態農業產業化指導專家組，10多人入選省“綠色低碳循環畜牧業技術示范點名單及專家團隊”。始終堅持“大別山道路”的精神，積極響應省委省政府的號召，主動服務三農，為我省畜牧業發展提供科技、人才支撐，服務地方經濟發展。1人擔任江淮分水嶺綜合試驗站站長，2人擔任皖西綜合試驗站、皖西北綜合試驗站產業聯盟首席專家。學院現有安徽省“115”產業創新團隊2個、省級教學名師1名、省級教壇新秀1名；有4人享受國務院津貼、有8人享受省政府津貼。學院現有在讀本科生、研究生近1500人。
畜牧學為安徽省A類重點學科，動物遺傳育種與繁殖學、預防獸醫學為安徽省B類重點學科。學院現有地方畜禽遺傳資源保護與生物育種安徽省重點實驗室、獸醫病理生物學與疫病防控安徽省重點實驗室、安徽省畜禽產業共性技術研究院、安徽省飼料質量與安全檢測中心等省級重點研究平臺。與企業共建獲批省級工程技術研究中心2個、院士工作站5個。近5年，主持國家及省市等科研項目310多項，獲得各類省部級科技獎勵8項，其中，一等獎2項、二等獎1項、三等獎5項；主持或參與獲得其他各類科技獎勵5項，發表論文（著）600余篇（部），授權發明專利110多項，主持起草通過28個地方標準、1個行業標準，新發現1個國家級品種資源——皖東牛，培育出國家級家禽新品系1個。
學院始終堅持開放辦學，近年來，先后與中國農大畜牧獸醫研究所、中國農科院、揚州大學、西北農林大學、福建農林大學等多所國內兄弟高校以及美國、英國、瑞士、捷克等多個國家的科研院所開展人才聯合培養、學術交流和科研合作，先后承辦國內外會議20多場次，有十多位教師在國際學術大會上作學術交流報告。
“豬糧安天下、牛羊強中華！”學院以人才培養為根本任務，以提高質量為核心目標，立足安徽、服務全國，培養高素質的應用型、復合型、“創新型、創業型”人才，成為培養高級畜牧、獸醫和水產養殖人才的搖籃。
