土木工程學院是東北林業大學規模最大的工科學院之一，前身是東北林學院1958年成立的林區道路工程專業；1964年成立林區道路工程系，1996年8月，經林業部批準，更名為土木工程學院。學院現有交通運輸工程博士后流動站；林區交通工程和道路與鐵道工程2個二級學科博士點；土木工程、管理科學與工程2個一級學科碩士點；交通運輸工程、土木水利（原建筑與土木工程）和工程管理3個專業學位碩士點；土木工程、工程管理、建筑環境與能源應用工程3個本科專業。土木工程本科專業于2010年率先通過住房和城鄉建設部本科教育評估，2017年工程管理專業、2018年建筑環境與能源應用工程專業已相繼通過本科專業評估。
學院擁有較雄厚的師資力量和資源。現有教職工113人，教授20人，柔性引進教授1人，國外兼職教授1人，副教授（高級工程師）49人，博士生導師19人，科學碩士生導師54人，專業學位碩士生導師78人，校外兼職碩士生導師34人，專任教師具有博士學位達到80%以上，獲得龍江學者、青年學者、黑龍江省教學名師、黑龍江省師德先進個人等諸多榮譽。在校生2038人，其中本科生1712人，研究生326人。學院有三個黑龍江省重點實驗室，實驗教學中心是黑龍江省實驗教學示范中心、黑龍江省“雙基”實驗室，設有國家林業局工程質量監督總站檢測中心，是建設部、交通部、國家林業局定點培訓單位。
學院師生員工牢記“學參天地，德合自然”的校訓，發揚“育土木人、塑土木魂、聚土木情、興土木業”的土木精神。經過幾代土木人的努力與追求，形成了以道橋為優勢，以寒區土木工程技術和管理為特色的特有辦學模式，取得了豐碩的育人成果。學院學生在“創新創業、學科競賽”方面取得了豐碩的成果，創新創業累計經費達110余萬元，學科競賽累計獲得國家級獎項80余項，省級獎項112余項。尤其是在“挑戰杯”全國大學生課外學術科技競賽、全國大學生結構設計競賽、全國大學生節能減排社會實踐與科技競賽中均取得了輝煌的成績，連續三年獲得國家一等獎。
土木工程學院積極投身改革，探索育人機制，與中國建筑第二工程局有限公司等16家單位簽署了校企合作協議，共同建設實踐教學實習基地，學生在校期間就可到大型企業工況復雜的綜合性工地和學校的帽兒山實驗林場進行生產實習，形成了特色鮮明的土木工程施工生產實習和道路勘測設計綜合實習模式。學院立足東北寒區，積極開展具有高寒地區特點的科學研究，先后承擔多項國家、省部級課題及技術研發與服務項目，解決寒區工程的疑難技術問題，取得了省部級科研成果，在服務于地方經濟方面取得了顯著成績。
為了適應國家改革開放的人才需求，積極開展對外交流，學院與美國科羅拉多大學丹佛分校、澳大利亞西澳大學等開展3+1+1聯合培養，學院工程管理專業與英國阿斯頓大學合作，開展3+1雙學位的合作辦學，與日本、英國、加拿大、俄羅斯、芬蘭、蘇丹等國家有關高校和相關行業，開展國際間的交流與合作，極大地提升了學院的辦學層次和國際影響力。
土木工程學院已走過了六十余年的歷程，為國家建設發展輸送了以全國政協副主席、致公黨中央主席、中國科學技術協會主席萬鋼為代表的一萬余名工程技術和管理人才，學生畢業走上社會后，大多數很快就成為土木工程行業設計、施工的技術能手，企業、事業的管理核心，教學、科研的學術骨干。如今，中國改革開放進入了高質量發展階段，人們期望接受高等教育，更期望享有越來越好的高等教育。土木工程學院伴隨著東北林業大學的發展，緊跟學校“雙一流”建設步伐，以提高人才培養水平和質量為核心目標，繼續優化教育內容，改善辦學條件，改進教學手段，創新教育管理機制，進一步加強學科專業建設，使土木工程學院辦學水平再上一個新臺階。
