廣州中醫藥大學于1973年開辦中藥學專業，1984年成立中藥系，1997年更名為中藥學院，是國內最早創立專門培養中藥學高級人才的院系之一。
中藥學院用于科教的總面積約4.4萬平方米，其中本科教學用場地近3萬平方米。學院有中藥學國家級實驗教學示范中心1個，國家中藥現代化工程中心1個，教育部國際聯合實驗室1個，廣東省重點實驗室2個，廣州市重點實驗室1個。儀器設備總值近1.5億元。近5年里，學院承擔國家和省部級科研190余項，累計科研經費1.3億元，以第一或通訊作者發表SCI論文367篇，獲國家專利47項，參獲國家科學技術進步獎二等獎1項，廣東省科學技術獎勵一等獎1項，其他省部級科學技術獎勵4項。藥理學和毒理學學科進入ESI全球排名前1%。
學院現實行學部管理運行體制，下設中藥資源學學部、藥物化學學部、藥理學與方藥學學部、藥劑學學部。共有教職工242人，其中博士生導師35人，碩士生導師94人。擁有國家杰青1人，長江學者講座教授2人，海外杰青2人，國家級百千萬人才1人，國家優青2人，全國中藥傳統特色技術傳承人3人，享受政府特殊津貼專家2人，珠江學者特聘教授3人，廣東省特支計劃“百千萬工程領軍人才”1人，廣東省“千百十工程”國家級培養對象1人，青年珠江學者2人，廣東省“杰青”2人，廣東省高等學校優秀青年教師培養計劃培養對象2人，“千百十工程”省級培養對象6人，廣州市珠江科技新星6人，省特支計劃青年拔尖人才1人。建設有3個省級教學團隊。學院與美國等海外20多所知名大學建立了學術交流與合作關系，先后兼職引進國外知名教授12名，全職引進海內外優秀人才24名。。
學院在45年的辦學歷程中，逐步形成了本科、碩士、博士多層次的人才培養體系。擁有中藥學一級學科學士、碩士和博士學位授權點，藥學一級學科學士和碩士學位授權點，中藥學專業學位碩士授權點，學院也是中藥學博士后科研流動站。中藥學院被學校納入中醫學雙一流學科群建設單位。中藥學和藥學學科是學校高水平大學建設的2個重點建設學科。藥學學科進入廣州市重點學科建設行列。此外，中藥藥劑學、中藥藥理學和臨床中藥學是國家中醫藥管理局重點學科。目前，學院共有全日制在校博士研究生130人，碩士研究生516人。
學院始終秉承卓越全人教育的理念，狠抓本科教育質量。現有中藥學、藥學、制藥工程、中藥資源與開發四個專業，在校本科生2055人。在全院師生的共同努力下，中藥學專業和制藥工程專業為“國家特色專業”和“廣東省名牌專業”，中藥制藥專業為“國家戰略性新興產業相關本科專業”，中藥資源與開發專業為“廣東省名牌專業”。學院建立了教學實踐基地49個，產學研合作基地31個。2018年開始，學院實施中藥學和藥學大類招生，優化專業設置，現設有中藥學、藥學和制藥工程3個專業。中藥學專業在二年級分化為中藥學、中藥資源與開發專業和藥品經營與管理專業方向。
