1975年，河南農業大學在全國率先開辦煙草本科專業，開創中國煙草高等教育之先河。2008年學校院系調整，成立煙草學院。2009年中國煙草總公司（國家煙草專賣局）與河南農業大學簽訂戰略合作框架協議，共建煙草學院。
學院現設有煙草、食品科學與工程（煙草工程）和香料香精技術與工程等3個本科專業；建有煙草學、煙草科學與工程、農藝與種業（煙草方向）、生物與制藥（煙草工程方向）等4個煙草類碩士點，1個煙草學博士點。擁有學士、碩士、博士和博士后完整的高等教育人才培養體系。其中，煙草專業入選國家級一流本科專業建設點，被評為國家級特色專業、河南省一流專業；煙草工程碩士點被評為“河南省特色品牌碩士專業學位授權點”。煙草栽培學榮獲國家精品課程、國家精品資源共享課程、省精品課程等榮譽；擁有省級一流課程4門，省優秀基層教學組織1個，省內外教學實習基地20多個。
煙草學學科被評為河南省第八批、第九批重點建設學科。學院建有國家煙草栽培生理生化研究基地、煙草行業煙草栽培重點實驗室、農業部煙草生物學與加工科學觀測實驗站等8個省部級科研平臺。
現有教職工77人，其中教授12人，副教授21人，博士生導師8人，碩士生導師31人，具有博士學位教師65人，國務院政府特殊津貼1人，中國煙草學會常務理事1人，國家煙草專賣局科技委委員2人，國家煙草專賣局學科帶頭人2人，河南省管優秀專家1人，河南省創新爭先獎章獲得者1人，河南省學術技術帶頭人2人，河南省拔尖人才2人，河南省骨干教師4人，河南省文明教師3人。
學院堅持“以人為本、崇尚學術、追求卓越”的辦學理念和“立足河南，面向全國，服務行業，走向世界”的辦學定位，以立德樹人為根本，以強煙興煙為己任，以培養拔尖創新人才和行業領軍人才為目標。秉承“寬口徑，厚基礎”的教育理念，構建“通專平衡，通專相宜”的課程體系。堅持以學生為中心，打造科教融合、產學結合、校企聯合、專業共享共建的人才培養模式。
學院先后與中國煙草總公司、江西省局、四川省局、海南省局、河南中煙、四川中煙長城雪茄煙廠、湖北中煙三峽煙廠、貴州畢節、吉林蛟河、河南三門峽、洛陽、南陽等行業單位簽訂了戰略合作框架協議。學院以“科技興煙”為宗旨，源源不斷地為行業提供科技創新成果，輸送高端技術人才，為推動煙草行業高質量發展做出了卓越的貢獻。
