首都醫科大學公共衛生學院前身是首都醫學院預防醫學系，該系是1988年經北京市衛生局批準由首都醫學院、首都醫學院附屬北京安貞醫院和北京市衛生防疫站共同組建而成立，2000年12月學系升格為公共衛生與家庭醫學學院，2013年1月更名為公共衛生學院。學院以服務北京、面向全國、放眼世界為宗旨，以為我國公共衛生事業培養合格的高質量人才為使命。學院下設六個學系和一個中心，即：流行病學與衛生統計學學系、勞動衛生與環境衛生學學系、營養與食品衛生學學系、兒少衛生與婦幼保健學學系、衛生毒理學與衛生化學學系、衛生管理與政策學系和教學實驗中心。學院校本部現有教職工101人，其中教師83人、實驗技術人員9人、管理人員9人。在教師隊伍中，有教授25人、副教授33人和講師25人；具有博士學位81人。擁有國家教育部公共衛生與預防醫學專業教學指導委員會委員、國家杰出青年基金獲得者、海外杰出青年人才、北京市高等學校教學名師、北京市百千萬人才、北京市特聘教授、北京市拔尖創新人才、北京市青年拔尖人才等，在國內各專業領域具有較高學術影響力。另外學院依托首都衛生管理與政策研究基地聘任國內知名衛生管理專家、北京市三甲醫院院長組成的兼職教授18人。
學院現有公共衛生與預防醫學一級學科博士學位授予點；公共衛生與預防醫學、公共管理學兩個一級學科碩士學位授權點、公共衛生專業碩士學位（MPH）授予點和一級學科博士后流動站；毒理與藥理學學科進入ESI排名前3‰，公共衛生與預防醫學一級學科在國內同類學科中位列B+（教育部第四輪學科評估）。學院現擁有公共衛生與預防醫學一級學科北京市重點建設學科、流行病學與衛生統計學北京市重點學科、臨床流行病學北京市重點實驗室、環境毒理學北京市重點實驗室、公共衛生安全北京市國際科技合作平臺、首都衛生管理與政策研究基地、北京市“一帶一路”國家人才培養基地、北京市校外人才培養基地、北京市實驗教學示范中心、北京市虛擬仿真中心/項目（2019）、中國營養學會“注冊營養師”課程教學基地、首都醫科大學國家健康醫療大數據研究院組成單位。首都醫科大學國家醫療保障研究院掛靠學院。
學院設預防醫學、公共事業管理（衛生事業管理方向）兩個本科專業。預防醫學專業2006年被北京市教委批準為首批北京市品牌專業、2008年建成國家級特色專業、2019年被評為北京高校“重點建設一流專業”、2019年入選“雙萬計劃”首批國家級一流本科專業建設；公共事業管理（衛生事業管理方向）專業2009年被評為北京市特色專業。預防醫學專業自1988年開始招生，公共事業管理（衛生事業管理方向）專業2000年開始招收本科生，目前在校本科生377人，近五年學生平均升學率達70%；博/碩士研究生在校生259人。學院為研究生、本科生共開設50余門課程。獲得各級教育教學成果獎15項，其中國家級教育教學成果獎1項，北京市級教育教學成果獎3項；建有國家級精品課程1門、北京市精品課程1門、校級精品課程6門；建設了國家級網絡資源共享課程1門、北京市在線開放式課程1門、校級網絡資源共享課程3門；雙語示范課程1門；獲批國家級優秀教學團隊1個、北京市優秀教學團隊1個、校級優秀教學團隊2個。
近五年，獲批科技部國家重點研發計劃4項（主持總課題2項、子課題2項），累計經費2400余萬元；獲批國家自然基金項目79項，其中中英國際科技合作重大項目1項、中意合作項目1項、重點項目4項，累積研究經費達4千余萬元。近5年在國際學術期刊發表高水平學術研究論文300余篇。同時，學院承擔多項衛生行政主管部門委托課題和政策咨詢工作，40余項研究成果被政府采納，在推進北京乃至全國醫改政策的制定和完善、推進醫學人才培養起到了重要作用。
學院與耶魯大學、內布拉斯加醫學研究中心、美國西北大學、英國職業醫學研究院、愛丁堡大學、倫敦衛生和熱帶醫學學院、赫瑞瓦特大學、自然環境研究委員會的生態水文中心、巴斯德研究所、威斯康星大學、墨爾本大學、埃迪斯科文大學、Monash大學、Deakin大學、LaTrobe大學、多倫多大學、東京大學等學校建立了良好的合作關系。首都衛生管理與政策研究基地通過舉辦“醫藥衛生體制改革與公共管理創新”論壇搭建政府、醫學界、產業界和學術界交流的平臺，架設不同學科、不同領域互學互鑒的橋梁，促進多學科交叉融合，增進跨界領域之間的思想碰撞與知識融合。
