石河子大學理學院成立于2011年6月，其前身是原石河子大學師范學院數學系、物理系、地理系。學院現有物理學、地理學二個一級學科碩士學位授權點，學科教學數學、學科教學物理、學科教學地理三個專業學位碩士授權點，一個校級重點培育學科；現有數學系、物理系、地理系三個教學系，下設信息與計算科學、應用物理學、土地資源管理、人文地理與城鄉規劃四個本科專業，同時承擔師范類數學與應用數學、物理學、地理科學專業課教學以及全校本科生、研究生的數學、物理相關公共基礎課的教學任務。
學院現現有數學實驗教學中心、物理基礎實驗中心、應用物理工程實訓與創新中心、地理綜合實驗教學中心4個實驗中心和生態物理重點實驗室、干旱區景觀生態重點實驗室2個重點實驗室，下設建制實驗室共9個，共計實驗分室67間，使用面積5300平方米。
學院擁有一支學術水平和教學水平較高，經驗豐富、治學嚴謹的教師隊伍。現有教職工118人，其中專職教師99人，專職實驗教師11人；專任教師中教授6人，副教授47人，博士18人、碩士68人，其中“寶鋼優秀教師”2人、“兵團教學能手”1人、兵團學術帶頭人1人。學院教師近年主持科研項目88項，其中國家自然基金21項，立項經費828萬元，出版專著3部，教材24部，發明專利授權4項，發表論文500余篇(SCI、EI收錄47篇)。
學院堅持以教學工作為中心，不斷深化教學改革，提高教學質量，特別對學生基礎知識和創新能力的培養尤為重視，積極組織和培訓學生參加數學建模、高等數學等省級、國家級競賽，并取得了較好的成績，數學建模競賽多次獲國際、國家一、二等獎。
學院始終以馬克思列寧主義、毛澤東思想、鄧小平理論、“三個代表”重要思想、科學發展觀、習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，全面貫徹落實黨的教育方針，堅持社會主義辦學方向，落實立德樹人根本任務，突出人才培養中心地位，深化教學改革，加強學科建設，不斷提高教育質量，立足兵團，服務新疆，面向全國，培養具有創新精神和創業能力的高素質復合應用型人才。
