山西醫科大學藥學院始建于1979年，是山西省最早培養藥學專業人才的教育基地。
學院現有教職工78人，專任教師64人。其中：教授20人，副教授18人，高級職稱占專任教師60%；博士51人，占專任教師比例80%。博士生導師10人，碩士生導師35人。學院擁有山西省教學名師1人，山西省“新世紀優秀人才”1人，山西省高校中青年創新拔尖人才3人，山西省高校優秀青年學術帶頭人2人，山西醫科大學非全職特聘教授1人。
2018年，藥學學科成為省級重點建設學科；現擁有臨床藥學二級學科博士點，藥學一級學科碩士學位授權點和藥學碩士專業學位授權點，2020年經校內動態調整增設藥學一級學科博士學位授權點。
擁有藥學（含藥物制劑方向）、中藥學、臨床藥學三個本科專業，其中藥學專業是首批國家一流本科專業，教育部高等學校特色專業建設點、山西省品牌專業、山西省優勢專業；中藥學和臨床藥學為省級一流專業。擁有山西省心血管疾病診治及臨床藥理實驗室、山西省藥學實驗教學示范中心、山西省虛擬仿真實驗教學中心、山西省藥學研究生教育創新中心、山西省優秀科技創新團隊、山西省道地藥材資源開發工程技術中心、山西省服務制藥產業創新學科群及山西省執業藥師培訓中心等多個教學科研團隊和服務平臺。
40余年來，藥學院秉承艱苦創業、立德樹人的優良傳統，傳承“醫理博精、德能高邃”的山醫校訓，謹遵“獻身、務實、團結、進取”的山醫校風，堅守“求實精進、堅韌弘毅”的山醫精神，堅持嚴謹治學、勇于創新的發展理念，現已發展壯大成為山西省藥學本科、碩士、博士多層次高等教育的重要基地。目前在校本科生規模約1300人，在校博、碩士研究生規模約150人。占地面積近1萬平方米，近三年投入2300余萬元，固定資產達4200余萬元。為社會培養應用型藥學專業人才5000多人，培養研究型藥學博士、碩士高級人才近500余人。
