云南農業大學資源與環境學院成立于2001年4月，前身為農學院土壤農化系和環境科學系。辦學歷史最早可以追溯到原昆明農林學院于20世紀50年代成立的土壤農業化學教研組，即后來農學院土壤農業化學系的前身。
經過多年的艱辛努力，學院現有：3個本科專業——農業資源與環境、環境科學和設施農業科學與工程；4個碩士點——土壤學、植物營養學、環境科學和水土保持與荒漠化防治；1個農業推廣碩士學位點——農業資源利用；1個省級人才培養基地——云南省環境科學與工程創新人才培養基地；1個省級重點學科——植物營養學；1個省級重點建設學科——農業資源利用；1個省級重點專業——農業資源與環境。
學院的組織機構設置體現以教學為中心，綜合辦公室和黨群辦公室是服務教學得管理機構，系和實驗室是本科教學的執行部門。學院有關教學、科研、人事、分配等重大問題由學院黨政聯席會議（正副院長和正副黨總支書記組成）研究決定。學院實行集體領導，教學行政院長負責制，日常工作由院長全面負責，副院長協助院長按分工負責教學、科研等某一方面的工作。學院黨總支書記和副書記負責黨務的工作和教工、學生的思想政治工作，對學院工作起保證監督作用。
學院的發展是在各級領導和社會各界的關心支持和全體教職員工的艱辛努力下，取得了今天的成績。天時、地利、人和，為學院今后的建設和發展提供了堅實的基礎和巨大的空間，學院將倍加珍惜今天的機遇，和諧拼搏，牢固樹立“育人為本，德育為先”之觀念，秉承“開學養正、耕讀至誠”之大學精神，激勵學子踐行“厚德博學、明理尚農”之校訓，立足云南、面向西南、輻射全國乃至東南亞，主要為地方經濟建設和社會發展服務，以本科教育為主，積極發展研究生教育，培養知識面寬、綜合素質高、動手能力強和具有創新精神的應用型高級專門人才。
