水資源與環境學院前身是原北京地質學院水文地質及工程地質系，1952年建校同時成立，1992年，為適應學科發展需要，改名為環境科學系；1998年，校內院系調整，稱為水資源與環境工程系；2002年，更名為水資源與環境學院。
學院現有的學科及專業橫跨三個一級學科：環境科學與工程、水利工程、地質資源與地質工程，生物學。目前，學院招收三個本科專業：環境工程、水文與水資源工程、地下水科學與工程；碩士專業：生物學、水文地質學、土木工程、水利工程，專業學位專業有環境工程、水利工程、地質工程；博士專業：環境科學與工程、水文地質學、土木工程、水利工程，其中博士學位授權一級學科點有環境科學與工程、水利工程。設有環境科學與工程、水利工程博士后流動站。學院水文學及水資源專業為北京市重點學科，地下水科學與工程專業為國家第一類特色專業和北京市特色專業。
學院現有教職工62人，其中專職教師53人，包括25名教授（博士生導師15人）、20名副教授，國家杰出青年基金獲得者2人。現有在校本科生534人，碩士生384人，博士生109人。
學院現有“水資源與環境工程北京市重點實驗室”和“地下水循環與環境演化教育部重點實驗室”，設有17個分室,面積約3200余平方米，儀器設備總價值約2400萬元；建有河北秦皇島柳江盆地水文地質專業實習基地、北京市排水公司環境工程實習點，產學研創新基地2個，是學院師生開展科研工作、實驗實踐教學工作的重要平臺。
近年來，學院承擔了‘863’、‘973’、‘十一五’國家支撐計劃項目、國家自然科學基金項目和省部級重大項目，獲得國家科技進步二等獎1次，省部級一、二等獎11 項。學院科學研究領域有水資源開發利用與保護、工程水文學、地下水系統模擬技術、環境水文地球化學、地下水環境工程、水處理工程、環境影響評價等。在地下水科學研究領域中，特別是裂隙水滲流、地下水污染控制、地下水資源評價管理、海岸帶地下水和地下熱水等方面取得了豐碩的成果。
學院國際交流活動廣泛，開展了與美國、加拿大、日本、荷蘭、德國、以色列等國家在科研和人才培養方面的國際合作，每年邀請數名國外著名學者來學院開辦講座或作學術報告，并派遣教員出國進修和參加各種國際學術會議。
水資源與環境是21世紀人類社會生存和發展的主要問題，學院的全體師生將以此為發展方向，堅持“面向現代化、面向世界、面向未來”的辦學方向，以“求真務實、自強不息”的精神，按“特色加精品”的辦學理念，努力營造“勤奮、嚴謹、求實、創新”的優良學風，與時俱進，為建設地下水特色的國內一流的教學科研中心而努力奮斗。
