水產學院是在1958年創建的工業捕魚教研組、生物養殖教研組基礎上發展起來的傳統與特色學院，至今已有近60年的辦學歷史。圍繞水產經濟的發展、水產品供應的保障和水產科技的進步，幾代人扎根海島、辛勤耕耘、幾度滄桑、繼往開來、開拓創新，在漁具力學、漁網制作與裁剪工藝等漁具革新應用技術，漁業資源生物學、漁業生態環境保護及漁業管理技術，水產苗種培育與養殖技術等方面開展系統研究和培養應用型高級專業人才，為浙江省乃至全國海洋漁業的發展提供技術創新和高水平人才保障。
學科建設
學院注重學科建設，已建成捕撈學、水產養殖學、漁業資源學等完整的二級學科體系，早在1996年捕撈學被列為浙江省重點學科，2008年海洋漁業科學與技術被列為浙江省重中之重學科。現擁有1個省級重點學科（水產學科），1個省級重點實驗室（浙江省海洋漁業裝備技術研究重點實驗室），設有1個一級學科碩士學位授予點（水產），5個二級學科碩士學位授予點（捕撈學、水產養殖學、漁業資源學、漁業經濟與管理、水產品加工與貯藏工程），1個農業推廣碩士專業學位授權領域（漁業），具有水產一級學科同等學力碩士學位授予權。
師資隊伍
學院重視師資隊伍建設，現有教職工43人，高級職稱人員25人，其中50%以上專任教師具有博士學位，另有11名國內外知名專家聘為客座教授。現擁有1個省級教學團隊（海洋漁業類課程群教學團隊）、1個省高校創新團隊（海洋漁業可持續發展創新團隊）。有浙江省“151人才工程”7人、浙江省高校中青年學科帶頭人5人，全國優秀教師1人，省級優秀教師2人；獲得舟山市科技青年獎、舟山市專業技術拔尖人才、舟山市有突出貢獻的專業技術人才稱號各1人。
人才培養
學院注重人才培養質量，按照“精神成人，專業成才”、“合格+特長”的模式培養人才，學生在創新創業、學科競賽、文化競賽等方面取得優異成績，在2014年“創青春”全國大學生創業大賽第九屆“挑戰杯”大學生創業計劃競賽榮獲金獎，在2013年第十三屆“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽中榮獲二等獎。近三年學生以第一作者公開發表論文163篇，授權專利13項，畢業生讀研率保持在25%以上，初次就業率保持在95%左右,為浙江省乃至全國海洋捕撈、水產養殖及其衍生產業培養了一大批應用型人才，為海洋經濟建設和社會發展做出了積極的貢獻，并形成了自己鮮明的特色。
