船舶工程學院前身系1953年創立的“中國人民解放軍軍事工程學院（哈軍工）”海軍工程系造船科。目前已經成為我國船舶工業、海軍裝備和海洋開發領域科學研究與人才培養的重要基地。2017年，船舶與海洋工程學科入選“雙一流”學科，并在國家第四輪學科評估中獲評A+。
學院設有“船舶與海洋工程”“港口航道與海岸工程”2個本科專業，其中“船舶與海洋工程”專業為國家級特色專業、國家級綜合試點改革專業、國家級卓越工程師計劃試點專業、國家級工程實踐中心、國防重點專業、黑龍江省重點專業，“港口航道與海岸工程”專業為黑龍江省重點專業。具有“船舶與海洋結構物設計制造”“流體力學”“港口、海岸及近海工程”“工程力學”“一般力學與力學基礎”“水力學及河流動力學”6個碩士學位授予權，具有“船舶與海洋工程”和“力學”2個一級學科博士學位授予權，具有“船舶與海洋結構物設計制造”“流體力學”“工程力學”“一般力學與力學基礎”4個二級學科博士學位授予權，設有“船舶與海洋工程”“力學”2個博士后科研流動站，其中船舶與海洋學科為國家級重點學科。
學院人才隊伍中有中國工程院院士1人，國家、省部各項人才計劃入選者包括：長江學者青年學者1人，龍江學者6人，新世紀優秀人才3人，優青1名，省杰青2人，青年拔尖人才2人，511人才1人，9人次獲評國家、省部級優秀教師。全院現有專任教師129人，其中正高級職稱37人，副高級職稱68人；博士生導師43人，碩士生導師113人；另有柔性教授16人。
在水下機器人技術、新船型開發及船舶設計、船舶與海洋工程流體力學、船舶與海洋工程結構力學、深海工程、海洋能開發、港口航道工程等方面，學院科學研究工作在該領域具有領先水平并擁有眾多標志性成果。
學院設有海洋運載器技術研究所、海洋工程技術研究所、艦船與海洋平臺總體技術研究所、船舶與海洋工程流體力學研究所、船舶與海洋工程結構力學研究所、船舶與海洋工程實驗中心6個基層學術組織，擁有水下機器人技術國家重點實驗室、船舶與海洋工程國家級實驗教學示范中心、多體船技術國防重點學科實驗室、船舶與海洋工程力學國際聯合研究中心、船舶與海洋工程國家級實驗教學示范中心等國家級平臺。
學院與國外30多所國際知名大學、10多家國際研究機構有著緊密合作，國際六大船級社及多家國內外造船企業、研究院所在學院設立專項獎學金。
