機電工程學院成立于1996年，學院前身為機電工程系，由中國人民解放軍軍事工程學院（哈軍工）艦炮專業發展而來。學院下設：水下作業技術與裝備研究所、船舶機械研究所、智能制造與機器人技術研究所、機械基礎系、工業設計系等教學科研機構。
學院現有“機械設計制造及其自動化”、“工業設計”2個本科專業；具有“機械工程”一級學科博士學位授權點；具有“機械設計及理論”、“機械電子工程”、“機械制造及其自動化”、“車輛工程”4個二級學科博士學位授權點；具有“機械工程”、“設計學”2個一級學科碩士學位授權點；具有“機械設計及理論”、“機械制造及其自動化”、“車輛工程”、“機械電子工程”、“設計學”5個二級學科碩士學位授權點；具有“機械工程”、“工業設計工程”2個專業碩士學院授權點和“機械工程”博士后科研流動站。其中，“機械設計制造及其自動化”、“工業設計”專業為省級重點本科專業，“機械工程”一級學科為黑龍江省重點學科。
學院師資力量雄厚，梯隊結構合理。學院現有教師123人，其中，教授29人，副教授45人，具有高級以上職稱的教師約占專任老師總數的80%。教師中有博士學位者69人，具有較高學位的青年教師構成了教師隊伍的主體，形成了一支業務水平高、科研素質好的教學、科研隊伍。
學院是國內較早從事艦炮、水下裝備研究的主要單位之一,主持或參與了多型艦炮、某深潛救生艇及對接技術、潛水作業裝備等國防急需項目，近年在艦船武器、機械強度與設計、水下作業技術、特種機器人技術、現代集成制造技術、導彈與飛行器控制等軍品研究中取得了豐碩成果，在機械、電子、自動控制等民用領域也取得了顯著成績，具有承擔機械工程領域重大應用基礎研究、新概念和新技術創新、國防預先研究和重點型號研制中關鍵技術攻關等能力。近五年，承擔科研項目180余項，其中國家重大科技專項、國家科技支撐項目、國家自然科學基金重點項目及國防“973”、高技術船舶等縱向項目60余項；科研經費超過1.7億元；獲國家級科技進步二等獎1項，省部級科技獎16項，發表論文800余篇，其中SCI276篇、EI檢索526篇；發明專利申請501項、授權430項，出版專著和教材28部。
學院具有配套的實驗設備和先進的測試手段，具有省部級重點實驗室3個和省部級工程中心1個，有25個專業實驗室，實驗室總面積約2150余平方米。其中，艦船特輔與水下裝備重點實驗室是工信部重點實驗室，CIMS研究中心是黑龍江省現代制造工程技術研究中心、水下作業技術與裝備實驗室為黑龍江省重點實驗室、機械工程實驗教學中心為黑龍江省實驗教學示范中心。
學院現有在校本科生1311人，碩士研究生499人，博士研究生113人，在站博士后研究人員10人，外國留學生35人。學院非常重視大學生科技創新活動，投入建設大學生科技創新基地，全面促進大學生科技創新與實踐能力的培養。近年來，學院獲得中國青少年科技創新獎3人次，“挑戰杯”全國大學生課外學術科技作品競賽獎12項，亞太大學生機器人電視大賽亞太季軍1次、全國亞軍1次、季軍1次，全國機械創新設計大賽獎13項，第53屆加拿大魁北克國際雪雕比賽二等獎，意大利布利克里奇國際雪雕大賽二等獎，首屆全國大學生工業設計大賽“中國工業設計獎”終評概念作品等國家級以上獎項185項、專利30余項。學院本科生參加科技創新活動比例連續多年達100%，其出色的創新精神與實踐能力深受用人單位好評。
