四川農業大學食品學院始于1987級畜產品加工專業，1988年由畜牧獸醫系畜產品加工、衛生檢驗、園藝系果蔬貯藏加工、農學系農產品加工教研室等部分從事農產品貯藏與加工，畜產品衛生檢驗等方面的教師，與農機系組建成立食品科學系，1993年更名為食品工程學院，1995年更名為工程技術學院，2002年更名為信息與工程技術學院，2009年3月食品學院獨立建院，2016年組建食品加工與安全研究所（副處級）。
學院設有食品科學與工程系、食品質量與安全系、包裝工程系共3個教學機構，6個研究中心/室，有1個副處級建制單位（食品加工與安全研究所）。學院現有食品科學與工程、食品質量與安全、包裝工程3個普通本科專業，食品科學與工程（教育）、食品質量與安全（教育）2個職教本科專業，其中“食品科學與工程”為省級特色專業、省級示范專業及省級卓越工程師計劃專業，“農產品加工及貯藏工程”為省級重點學科，擁有“食品科學與工程”一級學科碩士學位授予權，“食品加工與安全”農業碩士、“生物與醫藥”工程碩士專業學位授予權，“園藝產品采后科學”、“畜產品質量與安全”2個二級學科博士點，已經具有培養博士、碩士、普通本科、職教本科、成教、網教與自考等人才的能力，成為辦學類型和辦學層次齊全的教學研究型學院。
學院現有教師72人，其中教授11人，副高職稱32人，享受國務院政府特殊津貼專家1人，教育部教學指導委員會委員1人，四川省學術與技術帶頭人后備人選7人，四川省產業體系崗位專家3人；博士生導師7人，碩士生導師38人；具有碩士學位以上的教師占教師總數的90%以上，具有博士學位的教師占近的60%，40歲以下的青年教師占60%。
本學科屬于國家“211工程”建設學科和國家級“雙一流”帶動學科，在作物學、畜牧學、園藝學和生物學等優勢學科和動物營養、預防獸醫、作物遺傳育種等國家級學科平臺的帶動下，關注產業鏈中、后端產出需求和區域性產業發展需求，突出農產品的精深加工優勢和特色。近年來，我院主持和承擔了各級研究項目200余項，其中國家級和省級重大科研項目近100項，橫向課題及科技推廣項目100余項。在國內外各級學術刊物上發表論文800余篇，其中SCI、EI、核心期刊600篇，出版教材、專著50余部，獲省部級以上科技成果獎近20項，其中科技進步一等獎1項，二等獎3項，三等獎3項，獲得國家發明專利、實用新型專利400余項。學生獲得包括全國及四川省“挑戰杯”、“創青春”大賽以及食品行業、大學生包裝結構設計大賽等的各類獎項60多項，獲獎學生人數累計近400人。
在農產品加工與貯藏、食品營養與功能因子、食品包裝與安全性評價、農副產品精深加工與綜合利用等領域取得了重要的研究成果，形成了自己的特色和優勢，多數研究成果居國內領先水平，一些成果達到國際先進水平，為四川及西部的農產品精深加工、農村經濟發展做出了重要貢獻，許多成果已推廣應用到生產實際，取得了顯著的社會和經濟效益。
