石河子大學水利建筑工程學院由1960年創辦的石河子農學院水利系發展而來，在長期辦學過程中，學院以“尚水澤物，筑夢礪行”為初心，以向兵團、自治區、國家輸送德才兼備的綜合型人才為宗旨，不斷完善管理機制，提高教學科研水平，在學科建設和人才培養方面形成了具有鮮明區域特色和優勢的學科體系。
學院下設四辦、四系、一中心。四辦：黨政辦公室、學生工作辦公室、教學科研辦公室、研究生管理與學科建設辦公室。四系：水利工程系、土木工程系、給水排水工程系、工程力學系。一中心：實驗中心。
目前共開設5個本科專業：農業水利工程、水利水電工程、土木工程（建筑工程方向和道路橋梁工程方向）、建筑學和給排水科學與工程。擁有“農業工程”一級學科博士點，“農業水土工程”二級學科博士點，“農業工程”、“水利工程”和“土木工程”3個一級學科碩士點，土木水利一個專業學位類別，其中“農業水土工程”為自治區重點學科，土木工程、水文學與水資源、水利水電工程3個為校級重點學科。
學院現有教職工111人（其中具有高級職稱56人），專任教師79人，特聘院士2人，特聘教授2人。其中全國優秀教師1人，享受國務院特殊津貼7人，國家級人才3人，教育部教學指導委員會委員3人，農業部突出貢獻專家1人，中國農業水土工程學會副主任委員1人，兵團學術技術帶頭人3人，兵團特聘專家1人，兵團英才6人，綠洲學者8人。
學科平臺齊全，有2個國家級平臺、4個省部級平臺，12個教學研究實踐基地。學院擁有1個現代節水灌溉兵團重點實驗室和1個新疆兵團高烈度寒區建筑抗震節能技術工程實驗室，1個棉花生產技術現代化協同創新中心為兵團和校級協同創新中心，目前實驗中心面積超過21000平方米，儀器設備總資產6000余萬元，水利與土木工程實驗中心下設：測量學、土力學、建筑材料、材料力學、水力學、工程設計軟件等六個基礎實驗室，農業水利工程、水利水電工程、結構工程、建筑學、道路與橋梁工程、給水排水工程等六個專業實驗室，以及若干專業研究平臺。建設成為基礎條件優越、設備布局合理、儀器先進齊全、師資力量精干的西部一流工科試驗平臺。
學院科學研究特色：近些年，承擔國家973、863項目，九五、十五科技攻關項目，十一五、十二五科技支撐項目，十三五重點研發項目，國家自然基金重大及重點項目等50余項，以及150余項省部級及橫向項目，科研經費近億元；獲國家科技進步二等獎1項，獲省部級及行業科研獎50余項，科技服務成效顯著。
多年以來，水建學院堅持“立足兵團、服務新疆、面向全國、輻射中亞”的辦學定位，以校企聯合等形式，在搭建共建服務平臺上實現了共贏，做到在學科建設、人才培養、科研攻堅、隊伍建設和對外合作交流等方面全面發展。
